本片改编自花泽健吾的同名漫画，讲述了曾经辉煌一时的日本忍者，在战后被GHQ解散组织而消失，不过，他们潜伏在世界的所有机关，现代也暗中活动着，据说人数约为20万人。但基层忍者经常找不到工作，其中之一的云隐九郎（山崎贤人 饰）隶属忍者组织“NIN”的末端忍者（下忍），过着与啃老族无异的生活。一天，闲得发慌的他被判了一项重大的“忍务”，那就是调查战后70多年来一直潜入地下的某个组织的动向，其名为——“地下忍者”。忍术、智谋、最新科技等驱使了一切，从未有过的战斗现在开始。

　故事发生在日本的江户时代，一名神秘的男子出现在了武士桂小太郎（石田彰 配音）的面前，他手握妖刀“红樱”，要求试刀，这个夜晚之后，桂便下落不明。桂的宠物伊丽莎白（高松信司 配音）找到万事屋的神乐（钉宫理惠 配音）和新八（坂口大助 配音），委托他们寻找主人的下落。同时，银时（杉田智和）也受到委托，寻找四处作恶的红樱的下落。三人的线索汇聚到了一艘空中飞艇上，由于远离警察的管辖范围，飞艇里的恶势力一手遮天。在那里，银时遇见了曾经的战友现在的对手高杉晋助（子安武人 配音），高杉正带领着自己的鬼兵队企图毁灭江户。一面是穷凶极恶的恐怖分子，一边是暴虐嗜血的妖刀红樱，身受重伤的银时能够平安脱险拯救江户吗？

故事发生在江户时代末年，雾里（高冈早纪 饰）偶然之中遇见了孤女朝雾（安达佑实 饰），将她带回了妓院，训练其成为了游女。朝雾曾遭到母亲的虐待，身上遍布了樱花状的伤疤，却因祸得福，因为这异于常人之处而备受客人喜爱。                                                                    某日，在盛大的祭奠中，朝雾邂逅了名为半次郎（渊上泰史 饰） 的青年，善良老实的半次郎吸引了朝雾的注意，使得她坠入了情网之中。然而，身为妓院头牌，恋爱是被明令禁止的，朝雾因此而遭到了老板娘的斥责。之后，在吉田屋（津田宽治 饰）举办的宴会上，朝雾和半次郎重逢了，吉田屋察觉到了两人流露出的情谊，占有欲极强的他决定拆散他们。

住在山野市的山田家共有五口人：一家之主山田隆年届不惑，是一间小公司杂物课的职员。他有些大男子主义，经常为了些琐事和老婆吵吵闹闹，却又被丈母娘压得抬不起头来；阿隆的妻子松子和丈夫同岁，是个全职的家庭主妇，每天忙忙碌碌，照顾一大家子人的饮食起居，却又迷迷糊糊，经常丢三落四；松子的母亲年近古稀，然而精神矍铄，这位老人家一向特立独行，讲话毒辣，连暴走组也全不畏惧；长子阿升是个长相和学习都平平的中学生，他继承了母亲迷糊的性格，生活中乐事不断；小女儿野野子还是个小学三年级学生，瘦瘦小小的她碰上一群脑瓜秀逗的家人，经常成为被遗忘的对象。

就读于一流中学的八轩勇吾（中岛健人 饰）在升学考试中受挫，在此之后他出乎所有人意料选择了位于北海道的大虾夷农业高中就学。他的到来让新同学和老师都颇为震惊，因为这所学校主要面对农家出身的孩子，他们学得相应的农业知识后多数都是回家继承家业，日常的课程也是挤奶、饲养肉猪和直肠检查等。在大城市长起来的勇吾与周遭格格不入，多亏美丽善良的御影亚纪（广濑爱丽丝 饰）让他有了前进下去的勇气和动力。随着时间的流逝，他发现农家孩子们也并非高枕无忧，经济不景气的当下，农场随时有被收走的可能。他们热爱着散发着清香气息的土地，却无可奈何地看着田野成为别人的东西。少不更事的勇吾终于在生活的历练下一点点成长起来……本片根据荒川弘的同名漫画改编

　　本片与描写悠闲日常的短篇故事不同，是为了剧场电影化而由原作者中村光所描写的原作小故事。广阔宇宙中为数众多的一颗璀璨闪耀的生命之星——地球，平安度过世纪末的神之子耶稣和开悟佛的佛陀，一边感受着日本的四季变化，一边在下界享受着秘密的休假。两人住在东京立川没有浴室的6张榻榻米的一间公寓，分享冰淇淋，在附近的商店街享受抽奖，结成搞笑组合。某天，来自天界的使者出现在过着悠闲日常生活的两人身边，传达了禁断的提议。不久，神、佛、天使、恶魔混杂在一起，与意想不到的地球灭亡危机联系在一起！?

一场风流案件，导致性感妇人铃子（竹内結子 饰）死亡，他的丈夫矢部五郎（KAN 饰）作为杀人凶手遭到指控。菜鸟律师宝生绘美（深津絵里 饰）受命担任五郎的辩护律师，五郎提供的不在场证明竟是案发当夜被鬼压。虽然匪夷所思，宝生还是独自前往那座诡异的山庄，结果真的见到了压了五郎的 武士幽灵——后北条氏家臣更科六兵卫（西田敏行 饰）。六兵卫生前忠心耿耿，却被诬陷勾结敌人而遭斩首。因为对五郎的遭遇深有同感，六兵卫同意和宝生出庭作证。为了让那个别人完全看不到的幽灵到场，宝生真是绞尽脑汁，煞费苦心。在她的努力下，史无前例的幽灵庭审拉开序幕……

本作为此动画片画下完美句点，同名原著漫画拥有超高人气，销量卖破3,800万册。